Línea 5: Simulación Molecular y Biología Computacional
Los investigadores que trabajan en la línea 5 estudian los procesos de comunicación intercelular, activación de canales iónicos, dinámica neuronal y redes neuronales mediante una combinación de modelamiento y experimentación. Entre otros logros, esto les ha permitido determinar las relaciones estructura-función para canales de potasio y para otros canales como los sensores de dolor y temperatura TRPV1, TRPM8 y TRPV4. Las simulaciones de la excitabilidad neuronal permiten interpretar matemáticamente la contribución del canal TRPM8 a la sensación de frío. Con el uso de simulaciones moleculares a gran escala, los investigadores han contribuido al entendimiento de cómo las dimensiones del poro en la membrana celular determinan el transporte iónico en canales de potasio. Las simulaciones de dinámica cerebral a gran escala, usando datos reales del conectoma humano, han avanzado en el entendimiento del efecto de neuromoduladores en el cerebro. En cuanto a las técnicas empleadas se aplican métodos matemáticos y de simulación computacional avanzados.
Investigadores.
Danilo González / fono: (56) 2 2770 3606 / fernando.gonzalez@unab.cl
Patricio Orio / fono:(56) 32 2995538 / patricio.orio@uv.cl
Tomás Pérez-Acle / fono: (56) 2 9784603 / tomas@dlab.cl
Investigadores Asociados.
Daniel Aguayo / CBIB-UNAB / daniel.aguayo at unab.cl
Yorley Duarte / CBIB-UNAB / yorley.duarte at unab.cl
Investigadores Postdoctorales.
Cesar Ravello / fono (56) 32 2339217
Ignacio Díaz / DLab / FCV / fono:(56) 2 23672022 / ignacio.diaz at cinv.cl
Kesheng Xu / fono:(56) 32 2508185 / kesheng.xu at cinv.cl
Alberto J. Martin / DLab / FCV / fono:(56) 2 23672022 /ajmm at dlab.cl
Felipe Villanelo / DLab / FCV / fono:(56) 2 23672022 / felipe at dlab.cl
Germán Miño / fono: (56) 2 27703405 / german.mino.galaz at gmail.com
Hans Moldenhauer / fono:(56) 32 2508190 / hans.moldenhauer at cinv.cl
Leonel Medina / fono: (56) 2 23672022 / leonel.medina at cinv.cl
Alumnos y Tesistas de Doctorado.
Aland Astudillo / fono:(56) 32 2508185 / aland.astudillo.c at gmail.com
Alejandro Bernardin / fono:(56) 2 23672022 / abernardin at dlab.cl
Claudia Pareja / fono:(56) 2 23672022 / cpareja at dlab.cl
Gaspar Herrera / fono:(56) 32 2508047 / gaspar.herrera at cinv.cl
Melissa Alegria / fono: (56) 2 27703405 / ibi.malegria at gmail.com
Miguel Piñeiro / fono:(56) 32 2508185 / miguel.pineiro at cinv.cl
Rodrigo Santibañez / fono:(56) 2 23672022 / rsantibanez at dlab.cl
Romina Sepúlveda / fono: (56) 2 27703405 / rosepulveda87 at gmail.com
Samy Castro / fono:(56) 32 2508185 / sammy.castro at cinv.cl
Sebastián Contreras / fono:(56) 2 23672022 / scontreras at dlab.cl
Sebastián Gutiérrez / fono:(56) 2 23672022 / sebastian at dlab.cl
- Manzanares D, Araya-Durán I, Gallego-Yerga L, Játiva P, Márquez-Miranda V, Canan J, Jiménez Blanco JL, Mellet CO, Gonzalez-Nilo FD, García Fernández JM, Ceña V. (2017) Molecular determinants for cyclo-oligosaccharide-based nanoparticle-mediated effective siRNA transfection. Nanomedicine (Lond). 2017 Jul;12(13):1607-1621. doi: 10.2217/nnm-2017-0123.
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- Márquez-Miranda V, Abrigo J, Rivera JC, Araya-Durán I, Aravena J, Simon F, Pacheco N, Gonzalez-Nilo FD, Cabello-Verrugio C (2017). The complex of PAMAM-OH dendrimer with Angiotensin (1-7) prevented the disuse-induced skeletal muscle atrophy in mice. Int J Nanomedicine. 12:1985-1999. doi: 10.2147.
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- Villanelo F, Escalona Y, Pareja-Barrueto C, Garate JA, Skerrett IM, Pérez-Acle T (2017) Accessing gap-junction channel structure-function relationships through molecular modeling and simulations. BMC Cell Biol. 17;18(Suppl 1):5. doi: 10.1186/s12860-016-0121-9. PDF
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INSTITUTO MILENIO – CINV
Año: 2016-2021
Concurso: Proyectos Institutos Milenio 2009 – ICM09-022-P
Financiamiento: Ministerio de Ciencia, Tecnología, Conocimiento e Innovación
Investigador Principal: Ramón Latorre
Otros Investigadores: Juan Carlos Sáez, Alan Neely, Ana María Cárdenas, John Ewer, Kathleen Whitlock, Adrián Palacios, Tomás Pérez-Acle, Fernando Danilo González-Nilo, Oliver Schmachtenberg, Agustín Martínez, Patricio Orio, Andrés Chávez, Pablo Moya, Andrea Calixto, Carlos González
Otras Universidades o Instituciones: Centro Interdisciplinario de Neurociencia de Valparaíso, Pontificia Universidad Católica, Universidad Andrés Bello, Fundación Ciencia y Vida
LIGAND AND TEMPERATURE ACTIVATION IN TRPV1 CHANNELS: A THERMODYNAMICS AND MOLECULAR SIMULATIONS ANALYSIS
Año: abril 2017 – abril 2021
Concurso: Fondecyt Regular 2017 – # 1170733
Financiamiento: Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo (ANID)
Investigador Principal: Fernando Danilo González-Nilo
Otros Investigadores: Carlos González
Otras Universidades o Instituciones: Universidad Andrés Bello
CHAOS VERSUS NOISE AS DRIVERS OF MULTISTABILITY IN NEURAL NETWORKS
Año: abril 2018 – abril 2022
Concurso: Fondecyt Regular 2018 – # 1181076
Financiamiento: Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo (ANID)
Investigador Principal: Patricio Orio
Otros Investigadores:
Otras Universidades o Instituciones:
MOLECULAR MECHANISMS AT THE NANOBIO INTERFASE: APPLICATIONS AND BIOHAZARD
Año: abril 2018 – abril 2022
Concurso: Fondecyt Regular 2018 – # 1180987
Financiamiento: Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo (ANID)
Investigador Principal: José Antonio Gárate
Otros Investigadores: Ulrich Volkman
Otras Universidades o Instituciones: Pontificia Universidad Católica de Chile
PROTEIN INSERTION IN ARTIFICIAL MEMBRANES DEPOSITED FROM THE VAPOR PHASE: FROM BIOPHYSICAL FUNCTIONALITY TO NANOSENSOR APPLICATIONS
Año: abril 2018 – abril 2022
Concurso: Fondecyt Regular 2018 – # 1180939
Financiamiento: Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo (ANID)
Investigador Principal: Ulrich Volkman
Otros Investigadores: José Antonio Gárate
Otras Universidades o Instituciones: Pontificia Universidad Católica de Chile
EVALUACIÓN ADME/TOX DE D4: UN FÁRMACO CANDIDATO PARA EL TRATAMIENTO DE LA DISTRÓFIA MUSCULAR DE DUCHENNE
Año: enero 2019 – enero 2022
Concurso: Contratos Tecnológicos para la Innovación – # 18COTE-97972
Financiamiento: CORFO
Investigador Principal: Tomás Pérez-Acle
Otros Investigadores: Juan Carlos Sáez, Agustín Martínez
Otras Universidades o Instituciones: Fundación Ciencia & Vida
THE COLD-RECEPTOR TRPM8 CHANNEL CONTAINS A TEMPERATURE SENSOR AT COILED-COIL DOMAIN LOCATED AT C-TERMINUS END
Año: abril 2018 – abril 2022
Concurso: Fondecyt Regular 2018 – # 1180999
Financiamiento: Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo (ANID)
Investigador Principal: Karen Castillo
Otros Investigadores: Ramón Latorre, Fernando Danilo González-Nilo, Germán Miño
Otras Universidades o Instituciones: Centro Interdisciplinario de Neurociencia de Valparaíso, Universidad Andrés Bello
